Первоначально запланированная к выпуску осенью 2004 года, игра Area-51 подверглась критике в превью за то, что не внесла ничего нового в жанр. На полпути игра была отложена до выпуска весной 2005 года. За это время компания Midway внесла в игру множество изменений.
Европейская версия игры Area-51 сокращена по сравнению с выпуском в США: были сокращены два ролика и добавлены различные изменения в дизайн уровней, например, на уровне "Поиск" игрок должен активировать сканер с помощью отрезанной руки - в европейской версии дверь можно открыть без каких-либо хлопот. Немецкая версия еще более подвергнута цензуре: она убирает всю кровь (даже зеленую), эффекты тряпичной куклы, модели повреждений на врагах.
В октябре 2008 года версия игры для Windows стала доступна для бесплатного скачивания.
На первом уровне можно увидеть оригинальный аркадный автомат Area 51.