В центре сюжета Phantasmagoria - Эдриенн Делани, писательница, которая покупает большой особняк девятнадцатого века. Она и ее муж Дональд Гордон совершили покупку в надежде, что Эдриенн сможет "настроиться" на написание своего следующего романа. Чего Эдриенн и Дональд не знают, переезжая сюда, так это того, что бывший житель, волшебник Золтан Карноваш, был связан со смертоносной черной магией. Карноваш вызвал духа, который вселился в него и заставил убивать своих жен.
Эдриенн неосознанно высвобождает дух во время своего исследования дома и его артефактов, позволяя духу вселиться в Дональда. В результате в течение следующих нескольких дней Дональд становится все более агрессивным по отношению к ней, причем его поведение обостряется до такой степени, что он насилует ее. Кроме того, Эдриенн начинает слышать странную музыку и получает странные сообщения от машины для предсказания судьбы, которая находится в доме. Во время своего исследования поместья Эдриенн также обнаруживает Харриет и ее слабоумного сына, бездомную семью, которые поселились в амбаре поместья.
В Phantasmagoria играют как в обычную приключенческую игру в жанре point-and-click. Предметы можно собирать и добавлять в экранный инвентарь игрока. Головоломки решаются с использованием как предметов инвентаря, так и обстановкой окружения. Игроки, застрявшие в игре, могут нажать на красный череп, отображаемый в пользовательском интерфейсе, для получения помощи. Череп дает советы по каждому этапу игры.