Спустя пять лет после своего приключения на Планете сокровищ Джим Хокинс собирается окончить академию Королевского военно-морского флота. Однако таинственные корабли, известные как "Броненосцы", начинают появляться на Границе, как раз в тот момент, когда ведутся мирные переговоры с проционами. Джим начинает разгадывать тайну, стоящую за этими странными кораблями, и обнаруживает, что готовится масштабный заговор, возможно, с участием некоего пирата из его прошлого...
Хотя пространство игры трехмерное, бой больше похож на стандартные симуляторы военно-морского боя, и, таким образом, движение ограничено плоским уровнем. Игроки управляют своими кораблями в основном с помощью кликов мыши, как для перемещения, так и для приказа атаковать другие корабли. На корабле игроков может быть установлено различное оружие, включая легкие, средние и тяжелые пушки, абордажные крюки и другое специальное оружие, такое как гравитационные заряды и лазеры. Чтобы выстрелить, оружейные блоки должны быть обращены к врагу. Для достижения необходимых результатов можно нацелиться на различные секции вражеских кораблей; например, разрушение солнечных парусов существенно повредит корабль, позволяя игроку не торопиться с атакой.
При навигации необходимо учитывать естественные препятствия, такие как течения, астероиды и черные дыры. Назначение офицеров, обладающих определенными навыками, на борту улучшит эксплуатационные характеристики кораблей. Наличие большего числа членов экипажа также увеличивает ваши шансы при посадке, которую можно предпринять после успешного захвата судна.